Inspektorat Kabupaten Nagekeo dibentuk dengan Peraturan Daerah Kabupaten Nagekeo Nomor 3 Tahun 2016 tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah Kabupaten Nagekeo (Lembaran Daerah Kabupaten Nagekeo Tahun 2016 Nomor 3). Inspektorat merupakan unsur pengawasan penyelenggaraan pemerintah daerah dipimpin Inspektur, yang bertanggung jawab langsung kepada Bupati dan secara teknis administratif mendapat pembinaan dari Sekretaris Daerah.
Berdasarkan peraturan daerah tersebut, selanjutnya dibentuk Peraturan Bupati Nagekeo Nomor 45 Tahun 2016 tentang Kedudukan, Susunan Organisasi, Tugas, Fungsi dan Tata Kerja Inspektorat Kabupaten Nagekeo sebagaimana telah diubah beberapa kali dengan Peraturan Bupati Nagekeo Nomor 35 Tahun 2018 tentang Perubahan Kedudukan, Susunan Organisasi, Tugas, Fungsi dan Tata Kerja Inspektorat Kabupaten Nagekeo dan Peraturan Bupati Nagekeo Nomor 13 Tahun 2020 tentang Perubahan Kedua Atas Peraturan Bupati Nomor 45 Tahun 2016 tentang Kedudukan, Susunan Organisasi, Tugas, Fungsi dan Tata Kerja Inspektorat Kabupaten Nagekeo.
Inspektorat memiliki tugas pokok membantu Bupati dalam membina dan mengawasi pelaksanaan urusan pemerintahan yang menjadi kewenangan daerah dan tugas pembantuan oleh perangkat daerah.
Dalam melaksanakan tugasnya, Inspektorat menyelenggarakan fungsi, sebagai berikut:
Struktur Organisasi Inspektorat Kabupaten Nagekeo sesuai Peraturan Bupati Nagekeo Nomor 13 Tahun 2020 adalah sebagai berikut: